DC Field | Value | Language |
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dc.contributor.author | 장우혁 | ko |
dc.contributor.author | 정석훈 | ko |
dc.contributor.author | 정휘성 | ko |
dc.contributor.author | 현보라 | ko |
dc.contributor.author | 한동수 | ko |
dc.date.accessioned | 2013-03-09T13:04:59Z | - |
dc.date.available | 2013-03-09T13:04:59Z | - |
dc.date.created | 2012-02-06 | - |
dc.date.created | 2012-02-06 | - |
dc.date.issued | 2009-10 | - |
dc.identifier.citation | 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용, v.36, no.10, pp.851 - 860 | - |
dc.identifier.issn | 1229-6848 | - |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10203/96427 | - |
dc.description.abstract | 최근 계산을 통한 단백질 상호작용 예측 기법 중, 단백질 쌍이 포함하고 있는 도메인들 사이의 관계에 중점을 둔 도메인 정보 기반 예측 기법들이 다양하게 제안되고 있다. 하지만, 다수의 도메인 쌍들이 상호작용에 기여하는 정도를 정밀하게 반영하는 계산 기법은 드문 실정이다. 본 논문에서는 단백질 상호작용에 있어 도메인 조합 쌍의 상호작용 영향력을 수치화하여 반영한 상호작용 중요도 행렬을 고안하고 이를 기반으로 한 단백질 상호작용 예측 시스템을 구현한다. 일반적인 도메인 조합 기법과 달리, 상호작용 중요도 행렬에서는 상호작용을 위한 도메인간의 협업 확률이 고려된 Weighted 도메인 조합과, 다수의 Weighted 도메인 조합 중 실제 상호작용 주체가 될 확률을 도메인 조합 쌍의 힘(Domain Combination Pair Power, DCPPW)으로 수치화한다. DIP과 IntAct에서 얻어온 S. cerevisiae의 단백질 상호작용 데이터와 Pfam-A 도메인 정보를 사용한 정확도 검증 결과, 평균 63%의 민감도와 94%의 특이도를 확인하였으며, 학습집단의 증가에 따른 안정적인 예측 정확도 향상을 보였다. 본 논문에서 구현한 예측 시스템과 학습 데이터는 웹(http://code.google.com/p/prespi)을 통하여 내려 받을 수 있다. | - |
dc.language | Korean | - |
dc.publisher | 한국정보과학회 | - |
dc.title | 상호작용 중요도 행렬을 이용한 단백질-단백질 상호작용 예측 | - |
dc.title.alternative | Protein-Protein Interaction Prediction using Interaction Significance Matrix | - |
dc.type | Article | - |
dc.type.rims | ART | - |
dc.citation.volume | 36 | - |
dc.citation.issue | 10 | - |
dc.citation.beginningpage | 851 | - |
dc.citation.endingpage | 860 | - |
dc.citation.publicationname | 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 | - |
dc.identifier.kciid | ART001385031 | - |
dc.contributor.localauthor | 한동수 | - |
dc.contributor.nonIdAuthor | 장우혁 | - |
dc.contributor.nonIdAuthor | 정석훈 | - |
dc.contributor.nonIdAuthor | 정휘성 | - |
dc.contributor.nonIdAuthor | 현보라 | - |
dc.subject.keywordAuthor | domain combination pair | - |
dc.subject.keywordAuthor | weighted domain combination | - |
dc.subject.keywordAuthor | domain combination pair power | - |
dc.subject.keywordAuthor | protein interaction prediction | - |
dc.subject.keywordAuthor | possibility of domain collaboration | - |
dc.subject.keywordAuthor | 도메인 조합 쌍 | - |
dc.subject.keywordAuthor | Weighted 도메인 조합 | - |
dc.subject.keywordAuthor | 도메인 조합 쌍의 힘 | - |
dc.subject.keywordAuthor | 단백질 상호작용 예측 | - |
dc.subject.keywordAuthor | 도메인 조합 협업 확률 | - |
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