효모에서의 전사 단백질 복합체 시스템과 전사 보조인자에 대한 종합적 분석

Abstract

유전자 발현 조절은 세포 내, 외부의 신호에 대한 반응, 생체 내 조직 별 특성화된 기능 유지 등에 매우 중요하다. 진핵생물의 유전자 발현 조절은 다양한 레벨에서 복잡한 과정을 통해 이뤄진다. 첫 번째 조절 단계인 전사에서 전사인자는 유전자의 DNA로부터 RNA로 유전정보를 전달하는 것을 조절한다. 그 과정에서 전사인자와 함께 전사를 조절하는 전사 보조인자의 상호작용은 일차적인 조절 메커니즘으로 알려지고 있다. 따라서 정확한 전사 조절 메커니즘의 이해를 위해 전사인자를 찾고 기능적 연관성이 있는 전사 보조인자를 찾는 연구가 필수적이다. 단백질 복합체를 이용한 분석은 종합적인 전사과정에 대한 설명에 도움을 줄 수 있다. 본 논문에서는 효모의 전사인자 단백질 복합체 정보를 제공하는 웹 기반의 데이터베이스 시스템을 구축하였다. Gene Ontology와 KEGG pathway를 이용한 복합기능 enrichment 를 통해 모든 전사인자 단백질 복합체에 대해 기능 및 경로 정보를 제공한다. 또한 Support Vector Machine을 사용하여 전사인자 단백질 복합체 내에서 새로운 전사 보조인자를 예측하였다. 본 데이터베이스 시스템은 생물학적 기능을 가지는 1546개의 전사인자 단백질 복합체와 368개의 전사 보조인자를 제공한다. 이는 효모의 전사과정에서 유전자 조절에 대한 메커니즘을 연구하는데 유용한 정보를 활용 될 수 있다.