생체분자 네트워크의 진화과정에서 자기조직화의 역할 = The role of self-organization in the evolution of bio-molecular interaction networks

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자기조직화란 외부의 간섭 없이 system 내부의 구성요소들간의 다양한 상호작용으로부터 발생하는 전체 system level에서의 질서 창발을 뜻한다. 자기조직화는 자연에서 빈번하게 관찰되고 있는데 조개나 고동 껍데기의 pattern, crystal의 성장, 물고기 또는 새 떼들에서 보이는 군집행동 등이 그 예라고 할 수 있다. 이러한 자기조직화의 다양한 예들로부터 소수의 구성요소들간의 상호작용으로 인해 발생한 질서가 부분과 부분, 부분과 전체 사이의 상호작용을 통해 propagation되어 전체의 질서를 만들게 된다는 것을 알 수 있다. 본 연구에서는 entropy를 measure로 한 자기조직화의 개념 및 mechanism을 network growing process에 적용하여 초기 생성된 network 들이 자기조직화에 의해 어떠한 특징을 가지는지, 그리고 budding yeast cell-cycle network의 한 가지 property인 convergence라는 measure를 fitness로 하여network을 진화시켰을 때 자기조직화가 어떠한 영향을 끼치는 것인지, 끝으로 node size별 자기조직화의 효과는 어떠한 지를 살펴보았다. 이로부터bio-molecular interaction network의 하나인 budding yeast cell-cycle network 의 진화과정에서 자기조직화가 진화를 촉진시킨다는 결론을 얻을 수 있었다. 이러한 결론은, 진화의 mechanism이 자연선택과 더불어 자기조직화에 있을 수 있다는 가능성을 제시하여 주고 있다. 동시에 network이 어떠한 growing process를 거쳐 그러한 property들을 가지는 구조를 나타내게 되었는지 network 구조의 진화적 기원에 대한 새로운 실마리를 제공해 주고 있다.
Advisors
조광현researcherCho, Kwang-Hyunresearcher
Description
한국과학기술원 : 바이오및뇌공학과,
Publisher
한국과학기술원
Issue Date
2011
Identifier
467651/325007  / 020093153
Language
kor
Description

학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 바이오및뇌공학과, 2011.2, [ iv, 44 p. ]

Keywords

진화; 자연선택; 질서; 자기조직화; 엔트로피; entropy; evolution; natural selection; order; self-organization

URI
http://hdl.handle.net/10203/27216
Link
http://library.kaist.ac.kr/search/detail/view.do?bibCtrlNo=467651&flag=dissertation
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BiS-Theses_Master(석사논문)
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