유전체 분석 파이프라인의 I/O 워크로드 분석Genome Analysis Pipeline I/O Workload Analysis
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | 임경열 | ko |
| dc.contributor.author | 김동오 | ko |
| dc.contributor.author | 김홍연 | ko |
| dc.contributor.author | 박기한 | ko |
| dc.contributor.author | 최민석 | ko |
| dc.contributor.author | 원유집 | ko |
| dc.date.accessioned | 2019-04-18T04:50:12Z | - |
| dc.date.available | 2019-04-18T04:50:12Z | - |
| dc.date.created | 2019-04-18 | - |
| dc.date.issued | 2013-02 | - |
| dc.identifier.citation | 정보처리학회논문지. 소프트웨어 및 데이터 공학, v.2, no.2, pp.123 - 130 | - |
| dc.identifier.issn | 2287-5905 | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10203/261049 | - |
| dc.description.abstract | 최근 유전체 데이터의 급격한 증가로 인해 이를 처리하기 위한 고성능 컴퓨팅 시스템이 필요로 하게 되었으며 대량의 유전체 데이터를 저장 관리할 수 있는 고성능 저장 시스템이 필요하게 되었다. 본 논문에서는 대략 5억 개 정도의 시퀀스 리드 데이터를 분석하는 유전체 분석 파이프라인의 I/O워크로드를 수집 및 분석하였다. 실험은 86시간 동안 수행되었다. 1031.7 GByte 크기의 630개 파일이 생성되었으며 91.4 GByte크기의 535개의 파일이 삭제되었다. 전체 654개의 파일 중 0.3%인 2개의 파일이 전체 접근 빈도의 80%를 차지하여 전체 파일 중 일부분의 파일이 대부분의 I/O를 발생시킨다는 것을 알 수 있다. 요청 크기 단위로는 읽기에서 주로 512 KByte 크기 이상의 요청이 발생했고 쓰기에서 주로 1 MByte 크기 이상의 요청이 발생했다. 파일이 열려있는 동안의 접근 패턴은 읽기와 쓰기 연산에서 각각 임의와 순차패턴을 보였다. IOPS와 대역폭은 각 단계마다 고유한 패턴을 보였다. | - |
| dc.language | Korean | - |
| dc.publisher | 한국정보처리학회 | - |
| dc.title | 유전체 분석 파이프라인의 I/O 워크로드 분석 | - |
| dc.title.alternative | Genome Analysis Pipeline I/O Workload Analysis | - |
| dc.type | Article | - |
| dc.type.rims | ART | - |
| dc.citation.volume | 2 | - |
| dc.citation.issue | 2 | - |
| dc.citation.beginningpage | 123 | - |
| dc.citation.endingpage | 130 | - |
| dc.citation.publicationname | 정보처리학회논문지. 소프트웨어 및 데이터 공학 | - |
| dc.identifier.doi | 10.3745/KTSDE.2013.2.2.123 | - |
| dc.identifier.kciid | ART001749125 | - |
| dc.contributor.localauthor | 원유집 | - |
| dc.contributor.nonIdAuthor | 임경열 | - |
| dc.contributor.nonIdAuthor | 김동오 | - |
| dc.contributor.nonIdAuthor | 김홍연 | - |
| dc.contributor.nonIdAuthor | 박기한 | - |
| dc.contributor.nonIdAuthor | 최민석 | - |
| dc.description.isOpenAccess | N | - |
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- EE-Journal Papers(저널논문)
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