일 실시예에 따른 수술 항법 시스템은, 전자기파 발생부; 대상체의 수술부위에 부착되어 상기 수술부위에 부착된 위치를 감지하는 제1감지부; 상기 수술부위로 삽입되는 맞춤형수술가이드도구에 설치되고, 전자기파를 수신하고 상기 맞춤형수술가이드도구의 위치를 감지하는 제2감지부; 상기 수술부위로 삽입되는 보조수술도구에 설치되고, 상기 보조수술도구의 위치를 감지하는 제3감지부; 상기 맞춤형수술가이드도구가 상기 수술부위로 삽입된 경우의 상기 맞춤형수술가이드도구의 위치를 기준 위치로 설정하여 상기 제1감지부의 위치 및 상기 제3감지부의 위치를 등록하고, 상기 제1감지부가 상기 수술부위에 부착된 위치를 기준으로 상기 보조수술도구의 위치를 추적하는 정보처리부; 및 상기 대상체, 상기 맞춤형수술가이드도구의 위치 및 상기 보조수술도구의 위치를 포함하는 정보를 표시하는 표시부를 포함할 수 있다.