본 발명은, 생체(in vivo) 조직의 형태적 정보 및 조직으로부터 발생하는 형광(fluorescence) 신호의 시상수(lifetime)을 동시에 측정할 수 있는 멀티 모드 내시현미경 시스템에 관한 것으로, 보다 상세하게는 광섬유 래스터 빔스캐닝 유닛이 프로브안에 삽입된 구조를 제작된 내시현미경 프로브를 생체 내에 삽입하여 생체 내에서 방출되는 형광 신호의 시상수를 펨토초 펄스 레이저 및 TCSPC(Time correlated single photon counting) 모듈을 이용해 생체 내 조직의 특정 이온 농도, pH 등의 화학적, 형태적 정보를 함께 측정할 수 있는 내시현미경 시스템의 구조에 관한 것이다.