미생물 유전체 분석 기반 타입-2 폴리케타이드 합성 효소 및 폴리케타이드 예측 시스템 및 방법System and Method for the Prediction of Type-II Polyketide Synthases and their Polyketide Based on Microbial Genome Analysis

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dc.contributor.author이관수ko
dc.contributor.author김진기ko
dc.contributor.author김민성ko
dc.contributor.author선충현ko
dc.date.accessioned2017-12-20T07:18:07Z-
dc.date.available2017-12-20T07:18:07Z-
dc.date.issued2009-09-30-
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10203/231257-
dc.description.abstract본 발명은 미생물 유전체 분석 기반 타입-2 폴리케타이드 합성 효소 및 폴리케타이드 예측 시스템 및 방법에 관한 것으로서, 본 발명의 구성은 미생물 유전체 서열 정보를 입력받고 분석 결과를 출력하는 입출력 관리자, 폴리케타이드, 타입-2 PKS 및 타입-2 PKS 도메인 정보를 바탕으로 구성되어 있는 PKS 데이터베이스, 기계학습기를 훈련하는 기계학습 훈련부, 타입-2 PKS 도메인 예측에 사용되는 기계학습 분류부, 유전자 서열을 분석하는 서열 분석부, 유전자 클러스터를 분석하여 폴리케타이드를 예측하는 유전자 클러스터 분석부, 미생물 유전체 서열로부터 타입-2 PKS 및 폴리케타이드를 예측하여 출력 및 유전체 분석 결과 데이터베이스에 저장하는 유전체 분석부를 포함하는 것을 특징으로 하며, 본 발명에 의한 방법은 상기 기계학습 훈련부에서 타입-2 PKS 도메인 서열 정보에 기반하여 상기 기계학습 분류부의 은닉 마코프 모델 기계학습기를 훈련하는 단계(a); 상기 유전체 분석부에서 미생물 유전체 서열 파일을 입력으로 유전자 서열을 추출하는 단계(b); 상기 추출된 유전자 서열을 입력으로 상기 기계학습 분류부의 기계 학습기를 이용하는 서열 분석부를 통한 PKS 예측기를 이용하여 타입-2 PKS를 예측하는 단계(c); 상기 미생물 유전체 서열로부터 예측된 타입-2 PKS 유전자 정보들을 종합하여 탐색된 유전자 클러스터를 분석하는 폴리케타이드 예측기를 이용하여 폴리케타이드를 예측하는 단계(d); 상기 (c)와 (d) 단계에서 예측된 타입-2 PKS 및 폴리케타이드 정보를 출력하고 상기 유전체 분석 결과 데이터베이스에 저장하는 단계(e)를 포함한다.-
dc.title미생물 유전체 분석 기반 타입-2 폴리케타이드 합성 효소 및 폴리케타이드 예측 시스템 및 방법-
dc.title.alternativeSystem and Method for the Prediction of Type-II Polyketide Synthases and their Polyketide Based on Microbial Genome Analysis-
dc.typePatent-
dc.type.rimsPAT-
dc.contributor.localauthor이관수-
dc.contributor.nonIdAuthor김진기-
dc.contributor.nonIdAuthor김민성-
dc.contributor.nonIdAuthor선충현-
dc.contributor.assignee한국과학기술원-
dc.identifier.iprsType특허-
dc.identifier.patentApplicationNumber10-2008-0100233-
dc.identifier.patentRegistrationNumber10-0920782-0000-
dc.date.application2008-10-13-
dc.date.registration2009-09-30-
dc.publisher.countryKO-
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BiS-Patent(특허)
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