기질 농도와 반응조 형태가 수소 생성에 미치는 영향을 고찰하기 위하여 다양한 기질 농도 하에서 완전혼합형 반응조와 연속회분식 반응조를 운전하였다. 기질은 자당, 식종균으로 고정되었다. 두 반응조 모두 271일 동안의 전체 운전 기간 동안 안정적인 수소 생성이 지속되었다. 완전혼합형 반응조의 경우 유입된 기질대비수소 수율은 30g COD/L에서 1.1 mole H₂/mole hexoseadded를 나타내었으며, 기질 농도가 그보다 낮거나 높을 두 경우 모두에서 급격히 감속하였다. 35 g COD/L 이상에는 기질 분해율이, 20 g COD/L 이하에서는 아세트산 생성 등 수소 생성이 아닌 다른 기질 농도에서 기질 분해 효율과 미생물 농도가 CSTR에 비해 향상되었지만, 수소 수율은 오히려 감소하였다.