본 발명은 유전자 판별칩용 정량주입장치 및 이를 이용한 유전자 정량주입방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 PCR버퍼와 유전자가 혼합된 혼합PCR용액을 자동으로 신속하게 정량만큼 주입할 수 있도록 하기 위한 유전자 판별칩용 정량주입장치 및 이를 이용한 유전자 정량주입방법에 관한 것이다. 본 발명의 구성은 유전자와 PCR버퍼가 혼합되어 형성된 혼합PCR용액을 수용하는 복수의 정량챔버를 갖는 정량챔버부; 및 인접한 한 쌍의 정량챔버 사이에 각각 마련되며, 상기 정량챔버에 비해 상대적으로 높은 단차가 형성된 복수의 정량스토퍼를 갖는 정량스토퍼부를 포함하며, 상기 정량스토퍼는, 상류에 위치한 정량챔버에 상기 혼합PCR용액이 모두 채워진 후에 상기 혼합PCR용액이 통과할 수 있도록 단차가 형성된 것을 특징으로 하는 유전자 판별칩용 정량주입장치를 제공한다.