본 발명은 세푸록심 아세틸이 함유된 마이크로캡슐 및 이의 제조방법에 관한 것으로 보다 상세하게는 내부에 세푸록심 아세틸(Cefuroxime Axetil)을 함유하며, 내부를 감싸는 외부벽재는 자극 민감성 생분해성 고분자로 이루어진 세푸록심 아세틸이 함유된 마이크로캡슐 및 이의 제조방법에 관한 것이다. 본 발명은 자극 민감성 생분해성 물질 특히 pH에 민감한 생분해성 물질을 마이크로 캡슐의 외부벽재로 사용하고 내부에 세푸록심 아세틸을 포함하는 마이크로캡슐 및 이의 제조방법 제공을 목적으로 한다. 본 발명의 세푸록심 아세틸이 함유된 마이크로캡슐의 제조는 용매 100중량부에 대해 생분해성 고분자 0.5∼5.0중량부를 용해시키는 단계와, 전기의 생분해성 고분자가 용해된 용액에 세푸록심 아세틸 0.05∼3.0중량부를 혼합하는 단계와, 전기의 세푸록심 아세틸이 함유된 용액을 분무건조하여 용매를 제거하는 단계를 포함한다.