본 발명은 산화그래핀을 이용한 형광분석기반 효소 활성 검출 용액 및 방법에 관한 것으로서 상기 효소는 엔도뉴클레아제, 헬리카제 및 DNA 메틸트랜스퍼라제로 구성된 군으로부터 선택된 것이고, 간단하고, 빠르며, 저비용으로 효소 활성을 실시간으로 정량적 모니터할 수 있고, 다수 시료의 형광 변화를 지켜봄으로써 병렬적(parallel), 고효율고속(high-throughput) 스크리닝의 구현이 가능한 핵산 기질 효소 활성 검출 용액 및 방법에 관한 것이다. 본 발명의 활성 검출 용액 및 방법을 이용하여, 핵산 기질 효소를 이용하는 임의의 연구, 및 항바이러스를 포함하는 항미생물 치료, 항암치료에 있어 약물 후보물질로서의 효소 억제제의 스크리닝에 손쉽게 적용할 수 있을 것이다.