본 발명은 렌즈 제작 시 플루오르고분자 박막을 코팅하여 소수성 막을 형성시킴으로써 렌즈 배열의 충진률(Fill- Factor)를 향상시킬 수 있는 플루오르고분자 박막 코팅을 이용한 고충진률 렌즈 배열 및 이의 제조방법에 관한 것이다.본 발명에 따른 플루오르고분자(fluoropolymer) 코팅을 이용한 고충진률 렌즈 제조방법은 기판에 적어도 하나의 원통의 실린더 형상 패턴을 형성하는 단계; 상기 원통의 실린더 형상 패턴의 상부 및 상기 기판의 표면에 플루오르 고분자 박막을 코팅하는 단계; 및 상기 플루오르 고분자 박막이 코팅된 상기 패턴에 대해 열처리 공정을 수행하여 미세 렌즈를 형성하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 한다.